جلبک ها باعث سبز شدن استخر می شوند و عدم تعادل شیمیایی آب استخر می تواند باعث رشد جلبکها شود . اگر بنا به دلایلی مقدار کلر به اندازه کافی زیاد نباشد و کمتر از حد استاندارد، در استخر جلبک رشد خواهد کرد. به همین دلیل است که شوک کلر به عنوان بخشی از فرایند شش مرحله ای زیر، روی آب استخر شما اعمال میشود. بسیاری از استخرها نه فقط به رنگ سبز، بلکه سیاه می شوند که این به دلیل رشد جلبک سیاه در استخر است که بدترین نوع جلبک می باشد. برای مقابله با این مشکل می توان از Algiblack استفاده کرد و یا آب استخر را تخلیه کرده و اسیدشویی نمود .
